施甸县移民开发局成立于2006年11月3日（施机编〔2006〕33号），为正科级的行使行政职能的事业单位。核定行使行政职能的事业编制4名，工勤编制1名，其中科级领导职数1名。

2011年11月18日《施甸县人民政府办公室<关于印发施甸县移民开发局主要职责内设机构和人员编制规定的通知>》（施政办发〔2011〕239号）文件进一步明确：设立施甸县移民开发局，为县人民政府参照公务员管理的事业单位，不计入县政府机构，正科级，加挂“施甸县移民开发领导小组办公室”牌子；施甸县移民开发局暂定编制数4名，工勤编制数1名，其中：科级领导职数3名（局长1名，副局长2名）。非领导职务的设置和管理按有关规定执行；施甸县移民开发局内设办公室、规划股、后扶股和财务股4个股所级机构。

2017年末，实有在职在编人员6人，其中：行政编制人员4人（正科级1人，副科级2人，副主任科员1人），工勤编制人员2人。